過去の払いすぎた税金は？

昨今の不景気で10年間勤めた会社がこの10月末日で倒産することとなりました。
従業員である私は解雇となります。
近年の2年間は毎月の給与が10万円ほど未払い扱いとなっております。
（約30万→20万円）
ただ給与明細上では30万となっており、30万円にあう所得税、住民税を納めておりました。

平成24年度は1月にさかのぼって賃金台帳を20万円に書き換えると社長は言っておりましたので、来年に「確定申告」しようと考えております。

教えていただきたいのは、平成23年度の払いすぎた税金でございます。
過去の払いすぎた税金は取り戻すことが出来ますでしょうか？

また出来る場合、源泉徴収票は(30×12=360万円)となっております。
証拠としては給与明細しかございません。大丈夫なのでしょうか？

よろしくお願いします。