確定申告の修正（取り消し）

・私（サラリーマン）の配偶者控除の対象である妻が、昨年、パートをして、１００万円の収入を得ました。
・妻は、この他に、上場株式の配当として、２０万円の配当金収入がありましたが、１０％分の源泉徴収をされておりました。
・そのままにしておけば問題はなかったのですが、このパート収入と配当金を合わせて確定申告する必要があると思い、３月に確定申告してしまいました。
・その結果、若干の還付金がありましたが、先日届いた住民税の確定通知で、妻が、私の配偶者控除からはずれていることを知りました。
（質問）
　この確定申告を修正等して、妻を配偶者控除の対象に戻す事は出来ないのでしょうか？ご教示よろしくお願いします。